1.监管部门难以及时掌握假冒违法、有问题、有缺陷产品的信息。
2.监管部门难以实时查询药品从生产出厂、流通、运输、储存直到药品消费的全过程的情况。
3.消费者难以查询产品真实性和质量信息。
药品追溯系统可以监管企业的每一笔购销记录，通过平台就能够直接了解企业从什么单位购进哪些药品，又销售到哪儿去了。（一般药监监管平台只做到这一步，不能保证企业数据是否及时、准确上传。）
药品追溯系统可以让老百姓在购买药品后，只须在“药事通”机器上进行扫描，就可通过药监监管平台查询到该企业上传到平台里的该药品信息，从而真正让普通百姓参与到药品流通环节的监管过程中来。（通过直接消费者参与，解决数据不及时、准确上传的问题。）
1.监管执法部门可以及时掌握有关产品假冒违法的信息并迅速采取执法行动，对质量问题进行流程追溯和责任追究，对问题和缺陷产品进行及时准确的召回管理，将政府监管、企业自律和社会监督很好地结合起来，推动了和谐社会的建设。
2.有利于监管部门严格监控药品从生产出厂、流通、运输、储存直到药品消费的全过程实时查询每一盒、每一箱、每一批药品的生产、库存、销售及物流配送具体流向等情况，遇到问题药品时，能迅速追溯问题药品批次、数量、所在地、在线生产数量、尚余库存量等，最大限度降低召回成本。
3.消费者可以查询产品真实性和质量信息。
常州市康臣卫信信息科技有限公司开发的药品追溯系统已成功运用于常州市食品药品监督管理局新北分局。
